L’hypolimnion contient les eaux profondes puisqu’il s’agit de la couche inférieure de l’eau d’un lac. Celle-ci conserve une température basse et peu variable, soit autour de 4°C. La concentration en oxygène de l’hypolimnion subit généralement une baisse qui s’accentue durant l’été. Puisque les eaux de cette couche ne sont pas en contact avec l’oxygène atmosphérique, les réserves rechargées au printemps et à l’automne s’épuisent durant l’été et l’hiver. Le rythme d’une telle diminution sera dicté selon la morphologie du lac et sa productivité (consommation d’oxygène en profondeur par les organismes décomposeurs).